Υπάρχει η πιθανότητα για καθ’ έξιν αποβολές σε περίπου 5% των περιπτώσεων, όπου ένας από τους δύο και ορισμένες φορές και οι δύο, είναι φορείς κάποιας χρωμοσωμικής μετάθεσης γενετικού υλικού ή κάποιας άλλης χρωμοσωμικής ανωμαλίας με αποτέλεσμα τη δημιουργία ενός γενετικά ανώμαλου εμβρύου. Στα ζευγάρια αυτά συστήνεται η γενετική καθοδήγηση και η προεμφυτευτική διάγνωση που θα οδηγήσει στην επιλογή των χρωμοσωμικά υγιών εμβρύων σε ποσοστό που αγγίζει το 80%.